Секции Конференции
S3 Симпозиум с международным участием Биофизика сложных систем
Целью симпозиума является систематизация актуальных проблем биофизики сложных систем, и выявление тенденций научных исследований по различным направлениям вычислительной биологии и математического моделирования в биологии.
Сложная взаимосвязь процессов в живых системах обуславливает необходимость использования в исследованиях живых систем как экспериментальных методов, так и методов математического и компьютерного моделирования. Такой подход, получивший название «системная биология», позволяет в единой модельной системе представить данные о сложной биологической системе, полученные разными методами и относящиеся к разным временным и пространственным масштабам. Изучение свойств модели позволяет сформулировать новые вопросы и поставить новые задачи экспериментального исследования.
На пленарных и секционных заседаниях симпозиума будут обсуждаться проблемы применения методов вычислительной биологии для изучения субклеточных структур, жизнедеятельности и продуктивности микробных популяций, в радиационной биофизике, для решения задач медицинской и экологической биофизики. Коллеги из Лаборатории информационных технологий ОИЯИ поделятся опытом по использованию новейших информационных технологий в области хранения, поиска и передачи больших массивов экспериментальных данных. Специальные заседания будут посвящены проблемам молекулярного моделирования и использования методов квантовой химии, молекулярной динамики, крупнозернистого и броуновского моделирования при изучении процессов на разных уровнях организации живых систем.
На симпозиуме будут представлены на устных и стендовых сессиях и обсуждены работы молодых ученых, студентов и аспирантов совместно с ведущими специалистами в области молекулярной биологии, биофизики клетки, радиобиологии, спектроскопии, медицинской биофизики. В работе симпозиума предполагается участие специалистов из России, стран СНГ, Польши, Германии, Испании, Болгарии. Важной частью программы организаторы считают проведение тематических вечеров: история науки, издание российских научных журналов.
Программа симпозиума включает проведение тематических семинаров:
-
«Вычислительная и системная биология»
-
«Молекулярное моделирование»
-
«Медицинская и радиационная биофизика»
Организационный и программный комитет
- Андрей Борисович Рубин – член-корр РАН, зав. каф. биофизики биологического факультета Московского государственного университета имени М.В.Ломоносова – Председатель;
- Татьяна Юрьевна Плюснина – доцент каф. биофизики биологического факультета Московского государственного университета имени М.В.Ломоносова – Заместитель председателя Оргкомитета;
- Галина Юрьевна Ризниченко – профессор каф. биофизики биологического факультета Московского государственного университета имени М.В.Ломоносова – Заместитель председателя Программного комитета.
Программный комитет: О.В. Белов, Н.В. Белотелов, С.В. Беспалова, Н.Г. Есипова, Р.Г. Ефремов, Г.Р. Иваницкий, В.И. Заляпин, В.Е. Карпов, И.Б. Коваленко, А.В. Коганов, В.М. Комаров, Е.А. Красавин, В.Д. Лахно, А.И. Лобанов, Е.И. Маевский, Г.Г. Малинецкий, Т.Ю. Плюснина, А.А. Полежаев, Г.Ю. Ризниченко, Ю.М. Романовский, А.Б. Рубин, А.А. Сорокин, Ю.Ю. Тарасевич, А.Ю. Трифонов, В.Г. Туманян, М.Н. Устинин, М.Г. Хренова, С.В. Чернышенко, А.В. Шаповалов, В.А. Шувалов, Л.В. Якушевич, W. Ebeling, R. Pose.
Программа
30 января, вторник Аудитория 2-103
|
9.00–11.00
|
W1 Вычислительная и системная биология
|
|
|
Тирас Х. П. Динамическая морфометрия регенерации
планарий: критерии роста и морфогенеза
Ермаков А. С. Профессор Л. В. Белоусов и рождение
морфомеханики
Лавреха В. В. Математическое моделирование формирования
и поддержания структуры апикальной меристемы корня Arabidopsis thaliana
Потапова Т. В. Структурно-функциональная специализация
апикального сегмента растущей гифы Neurospora crassa
Халявкин А. В. Старение организма как поведение сложной
системы вне зоны устойчивости
Тирас Х. П. Почему российская биология не замечает биоэтику?
|
Аудитория 1-300
|
9.00–11.00
|
W2 Молекулярное моделирование
|
|
|
Никонов Э. Г. Молекулярно-динамическое моделирование
процессов взаимодействия водяного пара с несквозными порами цилиндрического
типа
Холмуродов Х. Т. Молекулярная динамика наноразмерных систем
и биомолекул (липидные бислои) в сочетании с методами нейтронного рассеяния
Жмуров А. А. Исследование упаковки ДНК в сферическую
оболочку методом молекулярного моделирования
Щербаков К. А. Моделирование взаимодействия производных
17(20)Е-прегна-5,17(20)-диена и 17(20)Z-прегна-5,17(20)-диена с андрогенным
рецептором человека
Рамазанов Р. Р. Люминофоры на основе комплексов
биополимеров и кластеров серебра: выявление структуры с использованием КМ/ММ
модели и данных люминесцентной спектроскопии
Ярошевич И. А. Теоретические исследования динамических
свойств каротиноидов и каротиноид-содержащих белков
|
Аудитория 2-103
|
16.00–19.00
|
W1 Вычислительная и системная биология
|
|
|
Комаров В. М. Об уникальности структурной организации
Y-хромосомы генома человека
Нечипуренко Ю. Д. Профили физических
характеристик регуляторных участков генома
Белов О. В. Динамическая модель репарации двунитевых разрывов
ДНК: модельный подход и применения
Новикова П. Ю. Происхождение полиплоидных видов
Arabidopsis ассоциируется с последними максимумами оледенения
Панина М. С. Моделирование индукции первичных
повреждений ДНК после действия тяжелых заряженных частиц в программной среде
Geant4-DNA
Рясик А. А. Оценка работы классификаторов на основе физических
свойств ДНК на примере E. coli
и B. subtilis
|
31 января, среда Аудитория 2-103
|
14.30–18.30
|
W1 Вычислительная и системная биология
|
|
|
Алексеева О. М. Моделирование естественного отбора первых
живых объектов
Нуртазина К. Математические модели нейробиологии
Бугай А. Н. Подходы к моделированию
радиационно-индуцированных нарушений функционирования нейроных сетей
гиппокампа
Шевченко М. И. Модель совместной работы двух осцилляторов
в сердечной клетке водителя ритма
Коробкина Ю. Д. Механизм прогестерон-индуцированной
кальциевой регуляции в сперматозоидах
Кузьмина Н. Б. Разработка комбинаторно сложных моделей
сигнальных путей в клетке (на примере активации ERK в ответ на ЭФР-стимуляцию) Смирнов Д. Н. Применение генетических алгоритмов для поиска оптимального набора параметров моделей
|
1 февраля, четверг Атриум
|
9.00–11.00
|
Стендовая сессия
|
|
W1 Вычислительная и системная биология
W2 Молекулярное моделирование
W3 Медицинская и радиационная биофизика
W4 Математические модели самоорганизации
|
Аудитория 2-103
|
15.00–18.00
|
W3 Медицинская и радиационная биофизика
|
|
|
Маевский Е. И. Метаболические подходы к моделированию
гипоксического и ишемического прекондиционирования
Смирнова О. А. Математические модели динамики системы гемопоэза у человека при остром и хроническом облучении
Пономарев И. А. Численное моделирование влияния
тромбообразования на питание васкуляризированной ткани Иванько Т. Ю. Математическое моделирование гидродинамической активации тромбообразования в стенозированных сосудах Приходько И. В. Оценка роли самоорганизации при активации T-лимфоцитов
Красняков И. В. Моделирование роста карциномы с учётом
дифференциации клеток при эпителиально-мезенхимальном переходе
Сорокин А. А. Сравнительный анализ
масс-спектрометрических профилей образцов опухолей мозга с использованием
методов многозначной классификации
Олешкевич А. А. Перспективы применения методов
математической нелинейной динамики в ветеринарной медицине
|
Аудитория 1-300
|
15.00–18.00
|
W2 Молекулярное моделирование
|
|
|
Шайтан А. К. Интегративное моделирование структуры
нуклеосом
Кузнецов А. С. Роль липидного окружения в формировании
димера гликофорина А
Коц Е. Д. Молекулярное моделирование механизмов регуляции
ферментативной активности Аспартоацилазы
Федоров В. А. Образование электрон-транспортного
белок-белкового комплекса пластоцианина и цитохрома f высших растений и цианобактерий
Кондратьев М. С. Молекулярный дизайн ингибиторов
водорослевого роста. QM-исследование
Хомич Д. А. Изучение молекулярных механизмов адсорбции
полилизина на липидные мембраны комбинированного состава
|
2 февраля, пятница Аудитория 2-103
|
9.00–11.00
|
W1 Вычислительная и системная биология
|
|
|
Логофет Д. О. Диалектика неавтономности в матричных
моделях популяций: точность калибровки против определенного прогноза
Сурков П. Г. К вопросу о моделировании группового
преодоления водной преграды Rangifer
tarandus L.
Пухальский Я. В. Влияние электромагнитного излучения на
сигнальные процессы в микробно-растительных биосистемах
Беляева Н. Е. Применение моделей фотосистемы 2 и
тилакоидной мембраны для оценки скорости выделения кислорода водо-окисляющим
комплексом
Ермаченко П. А. Система очистки воздуха в жилых помещениях
с помощью фотосинтезирующих микроорганизмов
Цветков И. В. Фрактальные методы биоиндикации
загрязнения атмосферного воздуха
|
|
