English
!

Архив публикаций

Тезисы

XVIII-ая конференция

Молекулярная динамика самоорганизации «белковоподобных» НР-сополимеров с различным процентным составом звеньев

Михайлюк М.Г., Терёшкина К.Б., Федик И.В., Шайтан К.В., Крупянский Ю.Ф.

Институт химической физики им. Н.Н. Семенова РАН, Россия, 119991 Москва, ул. Косыгина, 4. +7(495)9397300, yufk@chph.ras.ru

1  стр. (принято к публикации)

Создание функциональных полимеров на основе биомиметического подхода – актуальная задача в области наук о материалах и нанотехнологии. В основополагающих работах [1, 2] предложена схема создания специальных первичных «белковоподобных» структур НР сополимеров. Там же рассмотрена модель молекулярной эволюции белковоподобных сополимеров. Показано, что могут реализовываться как восходящая, так и нисходящая ветви эволюции, в зависимости от величины параметра взаимодействия РР единиц. В этих работах соотношение мономеров Н и Р, для простоты, бралось равным 1:1.

В настоящей работе методом молекулярной динамики рассмотрена самоорганизация НР сополимеров, при различном соотношении Н и Р единиц. Разбиение мономеров на гидрофильные, или полярные (Р) и гидрофобные (Н) единицы проводилось так же как и в работах [1, 2]. Число мономерных звеньев бралось равным 256. Соотношение Н и Р единиц варьировалось в широком интервале от 1:1 до 1:50. Величина взаимодействия между НН субъединицами (при температуре Т = 300 К) была выбрана равной 2kT и далее не варьировалась. Было показано, что практически при всех соотношениях Н и Р единиц радиус гирации сильно уменьшался при увеличении epsilon до 0,4 kT и далее с ростом epsilon плавно и незначительно убывал. Анализ данных свидетельствует о том, что восходящая ветвь эволюции реализуется выше определённого epsilon лишь при соотношении Н и Р единиц , превышающем некоторое критическое значение.

Таким образом, чтобы наблюдалось эффективное обучение (или восходящая ветвь эволюции) необходимо выполнение двух условий в ряду генерируемых поколений: высокая скорость сворачивания (критерий скорости обучения) и оптимальное соотношение между мономерами (Н:Р>=1:10).

Работа выполнена при поддержке РФФИ (грант 09-04-01081a) и гранта Отделения химии и наук о материалах (Программа 3/ОХ – 09).

Литература

1. Khokhlov A.R., Khalatur P.G. Conformation-Dependent Sequence Design (Engineering) of AB Copolymers // Phys.Rev.Lett., 82, 1999, p. 3456

2. Khalatur P.G., Novikov V.V, Khokhlov A.R. Conformation-Dependent Evolution of Copolymer Sequences // Phys. Rev. E, 67, 2004, 051901



© 2004 Дизайн Лицея Информационных технологий №1533